Postoje dnevne trajektne i brodske veze s Dubrovnikom, a trajekti također putuju na relaciji Prapatno (poluotok Pelješac) za Sobru, što znatno skraćuje vrijeme putovanja do otoka Mljeta.

Tijekom ljetnih mjeseci, brojni turističko-izletnički brodovi na području Nacionalnog parka (luke Polače i Pomena) iz Dubrovnika, Korčule, Makarske i poluotok Pelješac.
Glavna luka na otoku je Sobra, nalazi se na otočnoj istočnom kraju koji je povezan trajektom do Dubrovnika i Korčule sa Jadrolinijom. Također, postoji dnevni trajekt iz Dubrovnika za Sobru. Od Sobre, autobusi će vas odvesti do Pomene i Polača.
Tu je i putnički brod, Nona Ana, između Dubrovnika, Sobre i Polače koji ostavlja u jutarnjim satima i vraća se u poslijepodnevnim satima. Ona radi svaki dan ljeti i srijedom, petkom i nedjeljom u pred i posezoni.